医院设有脑病科、呼吸科、脾胃科、肾病科、心血管科、风湿内分泌科、高干/老年病科、血液透析科、内镜室、急诊科、重症医学科、针灸科、推拿科、康复科、医疗美容科、介入科、普通外科、甲状腺血管疝外科、乳腺外科、神经外科、泌尿外科、骨伤科、肛肠科、妇产科、儿科、眼科、耳鼻咽喉科、口腔科、皮肤科、麻醉科、疼痛门诊、药学部、超声科、检验科、影像科、病理科、心电图室等临床科室和医技科室。
一、国家临床重点专科建设项目：脾胃病科、神志病科。
二、国家中医药管理局重点专科：脾胃病科。
三、国家中医药管理局重点专科建设项目：肾病科、肛肠科、神志病科、治未病科、护理学科。
四、福建省中医重点专科：脾胃病科、康复科、脑血管科、肾病科、呼吸科、中医妇科、肛肠科、心衰专病、乳腺科。
五、福建省临床重点专科建设项目：呼吸科、风湿内分泌科、治未病中心、脑病科、针灸科。
一、优势病种：功能性胃肠病、早期胃肠癌、胃肠道息肉、胆总管结石、慢性肾衰、原发性肾病综合征、慢性肾小球肾炎、郁病、不寐、痴呆、中风病、颅内感染性疾病、脊髓疾病、肌萎、肌无力、颤症（帕金森病）、头痛、眩晕、慢性阻塞性肺疾病、颈椎病、中风病、系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、多发性肌炎、皮肌炎、强直性脊柱炎、骨关节炎、痛风、骨质疏松、面神经麻痹、支气管炎、肺炎、慢性咳嗽、支气管哮喘、慢性阻塞性肺疾病、支气管扩张、呼吸衰竭、感冒。
二、优势技术：胃肠镜检查、超声内镜检查、胶囊内镜检查、内镜下粘膜切除术（EMR）、内镜粘膜下剥离术（ESD）、内镜扩张及支架置入术、内镜下止血治疗—钛夹止血、注射止血、内镜下逆行胰胆管造影术、C13呼气试验—Hp检测、高分辨率固态食管测压、24小时Ph阻抗监测、高分辨率3D肛管测压、生物反馈治疗、胃肠氢呼气检查、红外线治疗、中药涂擦疗法、热奄包疗法、封包疗法、中药硬膏热贴敷治疗、挑治、割治、普通针刺、温针、微针针刺、头皮针、梅花针、火针、埋针、耳针、电针、磁热疗法、穴位注射、穴位贴敷、隔物灸、灯火灸、拔罐疗法、药物罐、刮痧、烫熨、内科疾病推拿、腹膜透析技术、颈椎导引操、肺功能锻炼操、五禽戏、彩超引导下乳腺穿刺活检术。
